Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Xab2Q9DCD2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms