Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rnf6Q9DBU5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rnf6Q9DBU5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rnf6Q9DBU5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rnf6Q9DBU5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rnf6Q9DBU5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rnf6Q9DBU5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rnf6Q9DBU5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnf6Q9DBU5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Rnf6Q9DBU5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf6Q9DBU5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms