Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ccdc97Q9DBT3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc97Q9DBT3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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