Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Chmp2aQ9DB34 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp2aQ9DB34 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms