Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc89Q9DA73 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms