Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem239Q9DA47 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem239Q9DA47 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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