Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Pdzd9Q9D9M4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Pdzd9Q9D9M4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Pdzd9Q9D9M4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdzd9Q9D9M4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdzd9Q9D9M4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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