Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Usp12Q9D9M2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Usp12Q9D9M2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Usp12Q9D9M2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Usp12Q9D9M2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Usp12Q9D9M2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Usp12Q9D9M2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp12Q9D9M2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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