Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmco5aQ9D9D5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms