Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atg7Q9D906 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg7Q9D906 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms