Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Derl3Q9D8K3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Derl3Q9D8K3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms