Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn22Q9D7U6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn22Q9D7U6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms