Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tube1Q9D6T1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tube1Q9D6T1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms