Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ttc9bQ9D6E4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ttc9bQ9D6E4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ttc9bQ9D6E4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ttc9bQ9D6E4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ttc9bQ9D6E4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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