Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms