Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

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Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf128Q9D304 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnf128Q9D304 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnf128Q9D304 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnf128Q9D304 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnf128Q9D304 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnf128Q9D304 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnf128Q9D304 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Rnf128Q9D304 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Rnf128Q9D304 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf128Q9D304 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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