Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps33aQ9D2N9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms