Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Necap2Q9D1J1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms