Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syf2Q9D198 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syf2Q9D198 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms