Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gtf2e1Q9D0D5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gtf2e1Q9D0D5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms