Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rab3bQ9CZT8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms