Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Shmt2Q9CZN7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms