Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Dnajc18Q9CZJ9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms