Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snf8Q9CZ28 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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