Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2fQ9CY34 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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