Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Snx7Q9CY18 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx7Q9CY18 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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