Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Utp23Q9CX11 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms