Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RpainQ9CWY9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RpainQ9CWY9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RpainQ9CWY9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms