Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms