Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Pfdn1Q9CWM4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pfdn1Q9CWM4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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