Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Q9CRC3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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