Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ykt6Q9CQW1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ykt6Q9CQW1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ykt6Q9CQW1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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