Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q9CQM1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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