Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccer1Q9CQL2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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