Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms