Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc5Q9CQA1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc5Q9CQA1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc5Q9CQA1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc5Q9CQA1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc5Q9CQA1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc5Q9CQA1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc5Q9CQA1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc5Q9CQA1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trappc5Q9CQA1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trappc5Q9CQA1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms