Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Use1Q9CQ56 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Use1Q9CQ56 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Use1Q9CQ56 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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