Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Krt88Q9CPR6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Krt88Q9CPR6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Krt88Q9CPR6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Krt88Q9CPR6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Krt88Q9CPR6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Krt88Q9CPR6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt88Q9CPR6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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