Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rpl17Q9CPR4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rpl17Q9CPR4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rpl17Q9CPR4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Rpl17Q9CPR4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl17Q9CPR4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Rpl17Q9CPR4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Rpl17Q9CPR4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Rpl17Q9CPR4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Rpl17Q9CPR4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Rpl17Q9CPR4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rpl17Q9CPR4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl17Q9CPR4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Rpl17Q9CPR4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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