Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brms1Q99N20 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms