Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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Hdac9Q99N13 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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Hdac9Q99N13 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Hdac9Q99N13 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Hdac9Q99N13 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Hdac9Q99N13 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Hdac9Q99N13 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Hdac9Q99N13 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Hdac9Q99N13 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Hdac9Q99N13 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac9Q99N13 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms