Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ms4a6cQ99N08 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a6cQ99N08 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms