Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Usp26Q99MX1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp26Q99MX1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp26Q99MX1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms