Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms