Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrrtQ99MR6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrrtQ99MR6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms