Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprtQ99M80 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms