Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gdpd3Q99LY2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gdpd3Q99LY2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms