Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TriobpQ99KW3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TriobpQ99KW3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms