Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms