Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcd2Q99JR8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcd2Q99JR8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcd2Q99JR8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcd2Q99JR8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcd2Q99JR8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcd2Q99JR8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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